コロナウイルスPCR検査の特異度を99％や99.9％という不適切な仮定で計算し、無症状者に対するPCR検査に反対している医師達の記事を書きました。
今回はコロナウイルスPCR検査の特異度の高さを裏付けるデータをまとめます。
海外
武漢
武漢で約137億円かけて989万人にPCR検査を実施、その結果は？
http://j.people.com.cn/n3/2020/0603/c94475-9697190.html
検査人数：武漢市で989万9828人に対してPCR検査を実施。
検査結果：新規感染者はおらず、無症状感染者を300人確認。検出率は1万人当たり0.303人。
検査数989万9828、陽性者300、陽性率0.00303％
陽性者を全て偽陽性と仮定しても特異度99.99697%
北京
北京市、感染再流行を抑制、集中的検査と選択的封鎖が奏功
https://www.jetro.go.jp/biznews/2020/07/f577624943580d82.html
北京市の7月3日の発表によると、6月11日以降、1,005万9,000人にPCR検査を実施済みで、陽性率は10万分の3.67だった。
検査数1005万9000、陽性率0.00367％
陽性者を全て偽陽性と仮定しても特異度99.99633%
ニュージーランド
NZ、行動規制を解除 世界に先駆け生活正常化
https://www.nikkei.com/article/DGXMZO60097650Y0A600C2EA1000/
ニュージーランド（NZ）政府は8日、新型コロナウイルスの感染抑制のため導入していた行動規制を解除すると発表した。8日午後11時59分（日本時間同日午後8時59分）から屋内外での集まりの人数制限やソーシャルディスタンス（社会的距離）規制を撤廃し、世界に先駆けて市民生活や経済活動をほぼ正常化させた。 第2波対策として、1日2千～3千件規模の検査体制は続け、外国人の入国禁止も継続する。
新型コロナ「勝利宣言」のニュージーランドにも新規感染者
https://www.newsweekjapan.jp/stories/world/2020/06/post-93713.php
ニュージーランドの保健省は6月16日、国内で新型コロナウイルスの新たな感染者2人が確認されたと発表。これで24日間続いた「新規感染者ゼロ」の記録が途切れた。
1日2,000～3,000件の検査を続け、24日間陽性者が0だったと解釈できます。
従って48,000～72,000件連続で陽性者0(特異度100％)だったと考えられます。
特異度99％の検査で48,000回連続で偽陽性が起こらない確率は3.09×10^-208%
特異度99.9％の検査で48,000回連続で偽陽性が起こらない確率は1.39×10^-19%
特異度99.99％の検査で48,000回連続で偽陽性が起こらない確率は0.823%
特異度99.999％の検査で48,000回連続で偽陽性が起こらない確率は61.9%
特異度99.9999％の検査で48,000回連続で偽陽性が起こらない確率は95.3%
特異度99％の検査で72,000回連続で偽陽性が起こらない確率は5.42×10^-313%
特異度99.9％の検査で72,000回連続で偽陽性が起こらない確率は5.19×10^-30%
特異度99.99％の検査で72,000回連続で偽陽性が起こらない確率は7.46×10^-2%
特異度99.999％の検査で72,000回連続で偽陽性が起こらない確率は48.7%
特異度99.9999％の検査で72,000回連続で偽陽性が起こらない確率は93.1%
ベトナム
検査数275,000、陽性者369、陽性率0.13％（2020年7月8日）
陽性者を全て偽陽性と仮定しても特異度99.87%
https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
ラオス
検査数18,091、陽性者19、陽性率0.11％（2020年7月8日）
陽性者を全て偽陽性と仮定しても特異度99.89%
https://www.worldometers.info/coronavirus/#countries
国内
岩手県
検査数1046、陽性者0、陽性率0％、特異度100％（2020年7月7日）
特異度99％の検査で1046回連続で偽陽性が起こらない確率は2.72×10^-3%
特異度99.9％の検査で1046回連続で偽陽性が起こらない確率は35.1%
特異度99.99％の検査で1046回連続で偽陽性が起こらない確率は90.1%
特異度99.999％の検査で1046回連続で偽陽性が起こらない確率は99.0%
福井県
5月4日～7月12日まで
検査数1736、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
特異度99％の検査で1736回連続で偽陽性が起こらない確率は2.65×10^-6%
特異度99.9％の検査で1736回連続で偽陽性が起こらない確率は17.7%
特異度99.99％の検査で1736回連続で偽陽性が起こらない確率は84.1%
特異度99.999％の検査で1736回連続で偽陽性が起こらない確率は98.3%
福島県
5月10日～6月13日まで
検査数3211、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
特異度99％の検査で3211回連続で偽陽性が起こらない確率は9.65×10^-13%
特異度99.9％の検査で3211回連続で偽陽性が起こらない確率は4.03%
特異度99.99％の検査で3211回連続で偽陽性が起こらない確率は72.5%
特異度99.999％の検査で3211回連続で偽陽性が起こらない確率は96.8%
大阪府
5月25日検査数441、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
5月26日検査数301、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
5月28日検査数423、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
6月1日検査数120、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
6月2日検査数370、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
6月4日検査数417、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
6月5日検査数398、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
6月10日検査数398、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
6月11日検査数386、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
6月13日検査数368、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
合計 検査数3622、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
特異度99％の検査で3622回連続で偽陽性が起こらない確率は1.55×10^-14%
特異度99.9％の検査で3622回連続で偽陽性が起こらない確率は2.67%
特異度99.99％の検査で3622回連続で偽陽性が起こらない確率は70.0%
特異度99.999％の検査で3622回連続で偽陽性が起こらない確率は96.4%
https://toyokeizai.net/sp/visual/tko/covid19/
Jリーグ
Jリーグ、PCR検査実施の全3070件が陰性
https://r.nikkei.com/article/DGXLSSXK50675_W0A620C2000000?s=5
Jリーグは26日、全選手や審判員らを対象に実施した新型コロナウイルスのPCR検査で全3070件が陰性だったと発表した。
検査数3070、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
特異度99％の検査で3070回連続で偽陽性が起こらない 3.98×10^-12%
特異度99.9％の検査で3070回連続で偽陽性が起こらない確率は4.63%
特異度99.99％の検査で3070回連続で偽陽性が起こらない確率は73.6%
特異度99.999％の検査で3070回連続で偽陽性が起こらない確率は97.0%
サッカーJリーグ PCR検査2回目も陽性確認されず 新型コロナ
https://www3.nhk.or.jp/news/html/20200708/k10012505051000.html
3182人が検査を受け、3054人が陰性となり、残りの128人は、検体の不足などで、8日までに判定が出ていないということです。
検査数3054、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
特異度99％の検査で3054回連続で偽陽性が起こらない確率は4.68×10^-12%
特異度99.9％の検査で3054回連続で偽陽性が起こらない確率は4.70%
特異度99.99％の検査で3054回連続で偽陽性が起こらない確率は73.7%
特異度99.999％の検査で3054回連続で偽陽性が起こらない確率は97.0%
2回の検査を合わせると検査数6124、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
特異度99％の検査で6124回連続で偽陽性が起こらない確率は1.86×10^-25%
特異度99.9％の検査で6124回連続で偽陽性が起こらない確率は0.218%
特異度99.99％の検査で6124回連続で偽陽性が起こらない確率は54.2%
特異度99.999％の検査で6124回連続で偽陽性が起こらない確率は94.1%
プロ野球
PCR検査について
https://npb.jp/news/detail/20200619_01.html
プロ野球12球団と日本野球機構は、開幕までに選手、監督、コーチ、球団スタッフ、NPB審判員らに対して新型コロナウイルスのPCR検査を実施、検査を受けた計2186名全員の陰性判定を確認いたしました。
検査数2186、陽性者0、陽性率0％、特異度100％
特異度99％の検査で2186回連続で偽陽性が起こらない確率は2.87×10^-8%
特異度99.9％の検査で2186回連続で偽陽性が起こらない確率は11.2%
特異度99.99％の検査で2186回連続で偽陽性が起こらない確率は80.4%
特異度99.999％の検査で2186回連続で偽陽性が起こらない確率は97.8%
罹患率が低い地域でのPCR検査の特異度 追記
罹患率が低い(感染者がほとんどいない)地域でのPCR検査の特異度について考えます。
PCR検査の偽陽性はPCR検査の原理を考えると検体の取り違え、検体の汚染等以外はほとんど考えられません。
罹患率が低い地域でのPCR検査では、これらが原因の偽陽性もほとんど起こらなくなります。
検体を取り違えても陰性検体どうしの取り違えならば、偽陽性にはなりません。
陰性検体で他の陰性検体を汚染しても偽陽性にはなりません。
従って罹患率が低い地域でのPCR検査では偽陽性は滅多に起こらないと考えても良いと思います。
このことはスクリーニング検査としてのPCR検査の有用性を裏付けます。
まとめると
コロナウイルスPCR検査の特異度が99％や99.9％ということは有り得ないことが明白になったと思います。
コロナウイルスPCR検査の特異度は99.9999%以上はありそうです。
